CHIP2026-面向生物医学全文的特定患者表型概念识别任务

Who this competition fits

适合具备生物医学文本挖掘或临床自然语言处理背景的参赛者，尤其是会处理PMC英文全文、HPO本体标准化，以及患者—表型关联抽取的人。个人参赛须依托单位报名；获奖队伍还需注册参加CHIP会议、口头汇报并撰写技术论文。

From registration to a first submission

1. 01

   生物医学英文文本处理

2. 02

   HPO本体与术语标准化

3. 03

   命名实体识别

4. 04

   实体边界与字符偏移计算

5. 05

   患者—表型关系抽取

6. 06

   JSONL数据处理

Before you commit: 难点在于不仅要从长篇全文中定位表型实体并精确映射到HPO，还要在同一文献的多个患者或家系成员之间正确归属表型；实体边界必须完全一致且HPO标识正确才算命中。输出还需符合包含字符位置、否定标记和患者关联的Jsonl结构，且不得使用外部人工标注表型数据集。